-Materials-Studio-培训教程.pptx
Class 1 -- Materials Studio 快速入门教程 该教程将介绍Materials Studio 软件的基本功能,在这一部分,你将学到: 一. 生成Projects 二. 打开并且观察3D 文档 三. 绘制苯甲酰胺分子 四. 观察并且处理研究表格文档 五. 处理分子晶体:尿素 六. 建造Alpha 石英晶体 七. 建造多甲基异丁烯酸盐 八. 保存Project 并结束 在d盘上建文件夹class 1: d:\class 1 -Materials-Studio-培训教程全文共77页,当前为第1页。 1. 建立一个新文件夹D:\ MS teach \ class1 2. 运行 Materials Studio,生成名称为My quickstart 的Project 或从运行菜单中运行:所有程序\ Accelrys Materials Studio 4.4 \ Materials Studio 生成一个Project 目的: 介绍Materials Studio 中 project 概念 模块: Materials Visualizer 在桌面双击快捷 式 -Materials-Studio-培训教程全文共77页,当前为第2页。 选择此文件夹存放数据 生成了名称为My Quickstart 的Project 写入My quickstart 这样就产生了新的 Materials Studio project,开始了Materials Studio 运行 -Materials-Studio-培训教程全文共77页,当前为第3页。 3. 恢复project 的默认设置(初学者不要做此操作) 本教学过程中,每一个新的 project 都使用 Materials Studio 自动产生的template project 的设置。保证 My quickstart project 也一样。 选择 Tools \ Settings Organizer ,打开Settings Organizer 对话框。 1. 点击此处的Materials Studio icon,选中所有的模块和图示工具。 2. 单击Reset,所有的模块和图示工具都恢复Accelrys默认值。 3. 在此可改变模块和图示工具的设置值。初学者慎用。 在layer builder中试试。 若干次操作后,已有一些参数设置。由于错误等原因,要重复前面的一个过程。为保存两次操作一样,需返回MS的默认设置。 -Materials-Studio-培训教程全文共77页,当前为第4页。 二. 打开并且观察3D 文档 目的: 介绍Materials Studio 中文档 documents 的概念模块: Materials Visualizer前提: 已生成一个Project Materials Studio 使用了多种类型的文件,如3D Atomistic and Mesoscale、text、chart、 HTML、 study table、grid、script、 和 forcefield documents。在后面进行计算时,这些文件将逐个显示在projects中,反映了计算的过程。 现在的教学中, 主要出现的是 3D Atomistic 类型的文件。 本节课包括以下内容: 1. 输入一个结构 2. 调整显示方式 3. 改变3D 结构的视图 4. 选择对象的不同类型 -Materials-Studio-培训教程全文共77页,当前为第5页。 1. 输入一个结构 File / Import,打开输入文件对话框 (注意,此对话框也可用工具栏上的输入按钮 打开)。 选择 Examples / Documents / 3D Model / TON.msi,单击 Import 按钮。 zeolite Theta-1 unit cell 右键旋转 -Materials-Studio-培训教程全文共77页,当前为第6页。 这个 3D Viewer 显示通常的 zeolite Theta-1 单胞。 文件 TON.xsd 是Project Explorer 中My quickstart project 的一部分。注意文件的扩展名已由.msi 变为 .xsd,这是3D 结构的 XML-based native Materials Studio 格式。 msi ? -Materials-Studio-培训教程全文共77页,当前为第7页。 2.调整显示方式 在 3D Viewer 上按右键,出右键菜单,选 Display Style ,Display Style 对话框中的各选项的意义如下: Atom 栏: Display Style: Line:线状模型。 Stick:棍状模型。 Ball and 《Materials Studio培训教程》是针对材料科学研究者和工程师的一份详细指南,旨在帮助初学者快速掌握这款强大的分子模拟软件。Materials Studio是Accelrys公司开发的一款综合性的材料科学模拟工具,它提供了各种模拟方法,包括量子力学、分子动力学、热力学等,用于预测和分析材料的性质。 一、生成Projects 在Materials Studio中,Project是组织和管理模拟工作的重要单元。创建Project是开始使用软件的第一步。你需要在指定的目录(如D:\MS teach\class1)下建立一个新的文件夹,然后启动Materials Studio,创建名为"My quickstart"的新Project。Project不仅可以存储3D模型,还包含了与计算相关的文本、图表、研究表、脚本等文件,便于跟踪整个研究过程。 二、打开并观察3D文档 在项目中,3D文档是常见的数据类型,尤其是3D Atomistic类型,用于表示原子级别的结构。通过File / Import导入示例文件(如TON.msi),可以加载3D模型。3D Viewer允许用户直观地查看和操作这些结构,通过右键菜单选择Display Style,可调整显示模式,例如Line、Stick、Ball and stick、CPK和Polyhedron等,以适应不同的分析需求。 三、绘制苯甲酰胺分子 在Materials Studio中,用户可以手动绘制分子结构,如苯甲酰胺。这涉及到添加原子、连接键、调整几何形状等步骤,这对于理解分子的构造和性质至关重要。 四、处理研究表格文档 研究表格文档(Study Table)用于记录和展示计算结果,可以方便地进行数据分析和比较。你可以导入、编辑和导出数据,以进行后续的统计分析或可视化。 五、处理分子晶体:尿素 Materials Studio支持对分子晶体的建模,例如尿素,用户可以构建晶格结构,模拟晶体的相变、热膨胀等现象,探究晶体的稳定性和反应性。 六、建造Alpha石英晶体 Alpha石英是一种典型的无机材料,通过Materials Studio,研究人员可以构建其晶体结构,进行能量最小化、动力学模拟等,研究其结构-性能关系。 七、建造多甲基异丁烯酸盐 对于复杂的有机化合物,如多甲基异丁烯酸盐,软件提供了构建复杂分子结构的功能,用户可以通过添加、删除和修改原子来创建所需结构。 八、保存Project并结束 完成上述操作后,记得保存Project以保留你的工作。保存Project不仅保存了3D模型,还保存了所有相关设置和计算历史,方便后续继续工作。 总结来说,《Materials Studio培训教程》涵盖了从基础操作到高级功能的全面指导,是学习和使用Materials Studio进行材料模拟的宝贵资源。通过这个教程,用户能够熟练掌握如何生成和管理Project,导入和显示3D结构,以及进行分子和晶体的建模,从而在材料科学的研究中实现更精确的预测和深入的洞察。



















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